O CIMA possui um elevado número de colaborações internacionais, atestado pelos 139 projetos com parceiros internacionais e por aproximadamente 423 artigos científicos produzidos em conjunto com investigadores de outros países, entre 2015 e 2020. Neste período, uma parte significativa do financiamento do CIMA foi através de projetos com financiamento internacional. A nível da formação avançada, o CIMA possui um forte nível de cooperação internacional, com o desenvolvimento de teses de mestrado e de doutoramento, ou estágios Erasmus, em parceria com instituições estrangeiras.
Como resultado da consolidação de parcerias internacionais, o CIMA encontra-se representado, através dos seus membros, em várias comissões de relevância internacional, tais como:
